W ramach Katedry i Oddziału Klinicznego Ginekologii, Położnictwa i Ginekologii Onkologicznej działają następujące oddziały:
- Oddział Położniczy (koordynator - dr n. med. Agnieszka Jurek)
- Oddział Patologii Ciąży (koordynator - dr n. med. Mateusz Zamłyński)
- Oddział Ginekologii Operacyjnej (koordynator - lek. Aleksander Drębkowski)
- Oddział Intensywnej Terapii Noworodka (koordynator - dr n. med. Helena Sławska)
- Blok Porodowy (koordynator - dr n. med. Andrzej Brenk)
Dodatkowow w ramach Oddziału Klinicznego działa:
- Izba Przyjęć
- Blok Operacyjny (koordynator - dr n. med. Łukasz Witek)